Yukito llega al pueblo con la esperanza de, a través de su espectáculo de marionetas, conseguir dinero con el que pagarse la comida. Allí conoce a Misuzu Kamio, una extraña chica que vive en el pueblo. Misuzu lleva a su casa a Yukito atrayéndolo con comida. Poco después de Haruko Kamio, la madre adoptiva de Misuzu, llega a la casa. Haruko inicialmente se opone a la permanencia de Yukito en la casa, pero más tarde decide que le permita permanecer en el lugar.

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Yukito explica a Misuzu la leyenda de la chica con alas que había estado en su familia por generaciones. Al día siguiente, el espectáculo de marionetas de Yukito solo atrae a un perro llamado Potato mientras que asusto a los demás. Yukito es capturado por Hijiri Kirishima mientras hacia el espectáculo enfrente de su clínica y esta le ofrece trabajos de apoyo.

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Los alrededores de Yukito y Misuzu cambian brevemente del templo a un cultivo como consecuencia de la experiencia de Kano. Luego de un enfrentamiento con Hijiri, Yukito y los demás van brevemente a la clínica. Yukito y Misuzu abandonan la clínica para volver a su casa. A mitad de camino Yukito se da cuenta de que no fue pagado por su trabajo de medio tiempo y vuelve a la clínica solo para ver la otra personalidad de Kano.

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Cerca del templo, en medio de su estado “zombie”, Kano estrangula a Yukito lo suficientemente fuerte como para que a este le quede una marca, luego cae inconsciente. Devuelta en la clínica, Hijiri se disculpa por el comportamiento de Kano y explica como y cuando empezaron los inusuales síntomas de Kano, con solo una simple pluma del templo.

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Yukito acaba pasando el día con Minagi y Michiru, mientras Misuzu está en la escuela. Yukito camina con Minagi a casa luego de ser invitado a hacer avistamiento de estrellas en la azotea de la escuela, allí se entera de la enfermedad mental de la madre de Minagi. Luego, Misuzu intenta jugar a las cartas con Yukito, pero la supera un extreme dolor. Cuando Yukito se entera de la condición de Misuzu decide irse de la casa.

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La condición mental de la madre de Minagi fue causada por que ella olvido que tenía una hija, Minagi huye de su casa y se une Yukito. Yukito le dice a Minagi que se va del pueblo, y ella desea ir con él, pero Yukito le insta para que le haga frente a su madre. Michiru es invitada a comer a la casa de Minagi. Michiru se va habiendo cumplido su propósito.

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Hay una serie de “flashbacks” que muestran a la madre de Yukito contándole de “la chica con alas”, sobre como ella olvidara todo y morirá cuando tenga su último sueño, y de cómo las personas cercanas a ella también morirán. La madre postiza de Misuzu se va dejando a Yukito y a Misuzu solos. Misuzu le cuenta a Yukito acerca de su último sueño y Yukito decide mantenerse a su lado, a sabiendas de las consecuencias. Yukito desaparece repentinamente, luego Misuzu se despierta sintiéndose mejor y se pregunta a donde se ha ido Yukito y si el volverá.

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Esta historia está situada 1.000 años antes de los acontecimientos hasta ahora relatados. Kanna es una chica con alas confinada en un palacio con su amiga, Uraha y su guardia, Ryuya. Cuando Kanna esta por ser enviada a otro palacio los, tres escapan y empiezan un viaje para encontrar a la madre de Kanna. Mientras tanto, el palacio es atacado y los tres son perseguidos. Ellos finalmente encuentran a la madre de Kanna, pero esta les dice que se vayan.

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La madre de Kanna afirma estar impura. Todos logran escapar de la montaña, pero sus perseguidores logran matar a la madre de Kanna. Antes de su muerte esta logra pasar la antigua oración a Kanna. Mientras los perseguidores se acercan, los tres hablan de asentarse cerca del océano. Kanna sabe que solo es un sueño. Kanna levanta vuelo pero los monjes la maldicen y termina asesinada a manos de los soldados. Ryūya y Uraha se enteran de la maldición y del sufrimiento de Kanna. Prometen tener un hijo que logre romper esa maldición.

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Los eventos ocurridos hasta este momento, exceptuando el “Arco del Verano”*, son vistos nuevamente pero desde la perspectiva de Sora, un cuervo que encuentra Misuzu.

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La maldición de Misuzu está empeorando. Al poco tiempo, ella olvida quien es Haruko y empieza a actuar extraño, jugando a las cartas consigo misma y rechazando ir al aire libre. Haruko está deprimida, pero intenta duramente restaurar la memoria perdida de Misuzu. Aparece el padre biológico de Misuzu y trata de quitársela a Haruko. Decide dejar que Misuzu elija con quien vivir. Haruko, desesperada por causa de la pérdida de memoria de Misuzu, le pide al padre de esta que le deje conservar a Misuzu tres días más con lo cual él está de acuerdo.

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El festival de verano finalmente ha llegado, pero desafortunadamente llueve el día en que se realizaría y el festival es cancelado. Queriendo hacer todo lo que pueda, por Misuzu, Haruko la lleva al templo local. Como madre postiza de Misuzu ¿Podrá Haruko salvar a Misuzu de retornar a su otro yo el vasto cielo azul?

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