Moroha Haimura tiene recuerdos de dos vidas pasadas y conoce a dos chicas, Satsuki Ranjou y Shizuno Urushibara. Sus pasados y sus presentes comienzan a entrelazarse.

Moroha y Shizuno ha sido recomendados para formar parte de los Saviors, una organización de gente con poderes para luchar contra el mal y Satsuki se siente realmente triste porque se ha quedado al margen y cree que le van a arrebatar a Moroha.

Después de que Moroha y las chicas derrotaran al Metaphysical, el Six Head de Inglaterra viene a Japón para interesarse personalmente por las habilidades que tiene ese muchacho.

Parece que van a trasladar a Shizuno a Inglaterra en contra de su voluntad, así que Moroha decide llevársela por la fuerza, algo que no le gusta nada al hermano de Shizuno. Por esa razón, envía a Edward para detenerlos y se inicia un enfrentamiento entre ambos.

Después del incidente con Edward, los Saviors aprovechan que están en plenas vacaciones de verano para irse a la playa a entrenar un poco, desconectar de las tensiones diarias y disfrutar del tiempo libre y el mar.

Mientras los Saviors siguen disfrutando de su tiempo libre en la playa, hace aparición un nuevo y terrible Metaphysical que ni siquiera aparecía en los registros de los Six Heads, así que tendrán que luchar al máximo de sus capacidades para derrotarlo.

Una nueva estudiante transferida desde Rusia llega a la clase de los protagonistas, y su primer movimiento es declarar su amor a Haimura y pedirle una cita. ¿Qué quiere realmente esta chica rusa? ¿Se quedarán sin hacer nada Ranjou y Urushibara?

Urushibara se enfrenta a la nueva chica rusa y le dice a Moroha que en realidad es una asesina rusa muy peligrosa. De todos modos, Moroha no termina de creer lo que le ha dicho y ayuda en la recuperación de las heridas que le hizo Urushibara... pero llega el momento de la revelación.

Después de la gran declaración de guerra, Haimura se dirige él solo a Rusia acompañado de la ayudante de Sir Edward. Allí, tendrán que hacer frente a numerosos enemigos que son increíblemente fieles a la Princesa del Rayo y están dispuestos a dar sus vidas por ella.

Haimura sigue avanzando por territorio ruso en busca de la Princesa del Rayo. Cuando alcanza el palacio, comienza un durísimo enfrentamiento, pero parece que Haimura no está tan solo como él se pensaba.

Cuando parece que todos los problemas están resueltos en Rusia, Haimura se tiene que quedar por la repentina aparición de un Metaphysical. Mientras tanto, en Japón aparece un Metaphysical aún más peligroso que amenaza con destruirlo todo.

Con la ayuda de Maya, Moroha consigue regresar a tiempo a Japón para enfrentarse al último Metaphysical que los amenaza, pero parece que ni siquiera él será capaz de hacerle frente, así que hará uso de toda la ayuda que tenga disponible.