Un adolescente japonés se despierta y se encuentra solo en una habitación vacía sin ningún recuerdo de su propia identidad o pasado. Inspecciona la habitación en la que se encuentra y descubre que es un turista japonés y de repente se da cuenta de que lo único que puede recordar es que alguien estaba tratando de matarlo. Mientras explora el edificio aparentemente abandonado, de repente es atacado nuevamente por la persona enmascarada de sus recuerdos y se le dice que luche con todo lo que tiene o muera. Mientras tanto, alguien observa remotamente sus acciones. Al decidir que quiere vivir, se defiende y momentáneamente obtiene una ventaja; mientras intenta dar un golpe mortal, la máscara se rompe y se revela que su atacante es una niña. En cambio, intenta irse, pero se encuentra rodeado por un desierto y la niña, que ya no lo ataca y se presenta como Ein, le dice que ahora vivirá como un asesino llamado Zwei o lo matarán.

Ein lleva a cabo un entrenamiento personal para Zwei después de aceptar trabajar con Inferno durante varios días, desde el combate en artes marciales hasta el uso de armas pequeñas para perfeccionar sus habilidades como posible asesino de Inferno en las próximas misiones aprobadas por Inferno. Claudia ingresa al complejo justo después de que Scythe Master recoge a Ein sin revelar su presencia y le cuenta a Zwei sobre los objetivos de Inferno, así como para darle "esperanza" a Zwei de que pueda descubrir quién es antes de que ella lo deje con un adiós. Mientras tanto, Scythe Master despliega a Ein en una misión de asesinato en algún lugar de los Estados Unidos para matar a una persona de interés.

Después de más entrenamiento con Ein, Zwei será evaluado. Tiene que matar a un hombre llamado Capitán Wallace de los Navy SEAL, que vendió armas a Inferno, pero porque no eran sus únicos clientes y vendió muchas armas a terroristas. Wallace eventualmente manchó el nombre de Inferno y los puso en peligro de ser sospechoso por el FBI después de que un agente del FBI fue encontrado muerto en México, lo que lo obligó a vencer a Zwei y derrotarlo en un duelo a muerte para permitir que Inferno reconstruya su la vida de nuevo. Después de dudar en matar a Wallace y casi ser asesinado por él, sus habilidades de asesinato se despiertan y le dispara a Wallace en la cabeza después de herirlo con un cuchillo de combate para apuñalarlo en el brazo derecho de Wallace.

Ein y Zwei reciben la orden de matar a Don Lucio, el jefe de una familia mafiosa con sede en Dallas, Texas, como su primera misión juntos. Debido a que nunca sale de su mansión, los dos asesinos Phantom tienen una oportunidad de hacer que la misión funcione o no. Con la ayuda inesperada de Scythe Master, quien condujo para ayudar a los dos asesinos a escapar, Ein y Zwei pudieron matar con éxito a su objetivo asignado y huir por seguridad. Posteriormente, los dos fueron enviados al extranjero para pasar desapercibidos debido al éxito de su misión. Zwei reflexiona sobre cómo Inferno lo había adoctrinado con éxito como un asesino y asesino a sueldo ahora hábil.

Inferno intenta establecer contacto con una familia de la mafia en algún lugar de Los Ángeles dirigida por Tony Stone, quien actualmente estaba arrestando personalmente a personas que vendían drogas en Melanie Square. Durante este tiempo, Claudia invita a Zwei a su propiedad para que actúe como su guardaespaldas secundario y espía para mantener el reconocimiento de la mafia. Cuando la reunión para que Inferno ejerza su influencia en Melanie Square no estaba funcionando a su favor ya que Tony se niega a hacerlo, Ein y Zwei se despliegan para acabar con toda la mafia y asesinar a la esposa y al único hijo de Tony para demostrar que Inferno es Una fuerza a tener en cuenta.

Los miembros sobrevivientes de la mafia de Tony planean vengarse de Inferno al planear publicar información crucial sobre ciertos mafiosos que sospechan que apoyan a Inferno detrás de escena para desacreditarlos y ser eliminados desde adentro. Sin embargo, Inferno planea llevar a cabo una ola de asesinatos de todas las personalidades de la mafia anti-Inferno en la costa oeste de los Estados Unidos con Ein y Zwei al frente trabajando con Lizzie para llevar a cabo los asesinatos por orden de sus principales líderes bajo la insistencia de claudia Gracias a sus esfuerzos, Inferno pudo consolidar su influencia en la zona.

Ein deja a Zwei para encontrarse con Scythe Master, mientras que Zwei decide practicar su conducción mientras ella no está. Sin embargo, McCunnen aparece y comienza a acercarse a Zwei, a lo que Scythe Master advierte a Ein que no permita que el encaprichado McCunnen se lleve a Zwei. Mientras tanto, la Sra. McCunnen comienza a formar sus propios planes dentro de Inferno. Más tarde en el día, Zwei tiene un sueño sobre su pasado, donde es testigo del asesinato de un objetivo de Inferno, disparado por Ein. Después de huir durante días, Zwei es atrapado por Ein y Scythe Master, quien parece interesado en su habilidad innata para sobrevivir. Después de despertarse, Zwei le pregunta a Ein si ha tenido algún sueño sobre su pasado, a lo que ella responde que sí.

Ein es enviado a eliminar a los secuaces de Inferno en un distrito de almacenes como parte de un plan tramado por Raymond y Claudia para eliminar a Scythe Master. Claudia, al convocar a Zwei a su mansión, le da su pasaporte japonés y revela que su verdadero nombre es Reiji Azuma. Cuando Zwei está en estado de shock, Claudia le ofrece un lugar junto a ella después de revelar sus sentimientos.

Reiji, que ahora rechaza su nombre en clave Phantom Zwei, escapa con Ein mientras el resto de Inferno se preocupa por su escape. Ein había planeado suicidarse disparándose a sí misma ya que no tenía un lugar al que llamar hogar antes de que Reiji impidiera que se suicidara. Él la consuela y le da un nuevo nombre e identidad propia: Elen. Ellen se encuentra con Scythe Master en un callejón después de dispararle a un hombre armado que la buscaba. Lizzie y Claudia capturan a Reiji en un estacionamiento cuando estaba a punto de conectar un auto. Posteriormente, Reiji fue interrogado y acusado de ayudar a Scythe Master a rebelarse contra Inferno. Claudia le ofrece ayuda a Reiji para salvar a Ellen, encerrada en un lugar desconocido, soltándole las ataduras y ofreciéndole una pistola para que la use. A cambio, Reiji le promete a Claudia que cuidará de Scythe Master.

Lizzie y su grupo son enviados por Claudia con el objetivo de asesinar al Scythe Master, al enterarse de su paradero. Aunque a regañadientes, Lizzie también admite a Reiji en el equipo de asesinato y la envían al muelle de San Francisco.

Tres meses después de la muerte casi fatal de Reiji a manos de Scythe Master en el distrito del muelle de San Francisco, Inferno pudo tomar el control de algunas de las familias criminales en el área este de los Estados Unidos e integrarlas bajo el control de Inferno bajo el mando de Claudia. dominio. Isaac le confía a Raymond que Claudia puede estar actuando de manera sospechosa después de la conferencia. Más tarde se vio a Claudia visitando la tumba de Romero McCunnen. Reiji, que ahora toma el nombre en clave de Zwei nuevamente después de recuperarse de sus heridas, es declarado Phantom por Raymond después de matar a varios hombres armados en un complejo de almacenes desconocido.

Seis meses después, Reiji acaba de derrotar al hombre número 2 de la familia Gambino en su última misión, dejando a Inferno con el control exclusivo de la costa este y sembrando el miedo en el inframundo criminal. Claudia recibe permiso de McGuire para manejar directamente las negociaciones con la familia Godoh para controlar el monopolio de las exportaciones a Japón.

Isaac acusa a Reiji de mentir para esconder a Cal de él, ya que quería interrogar a Cal sobre los tiroteos en su territorio. Reiji y Lizzie se enfrentan a McGuire, Isaac y Claudia sobre si el primero les estaba ocultando algo. Él promete entrenar a Cal para que sea una asesina como él, ya que afirma que ella tiene el potencial para ser una asesina como él. Antes de ir a la reunión, Cal le mostró los $ 5 millones de dólares que ella escondió de la escena después de que Judy fue asesinada por fuego perdido y le suplicó que matara a los responsables de la muerte de Judy ayer. Al final, Reiji está en conflicto sobre cómo podría vengar la muerte de Judy y entrenar a Cal para que sea un asesino exitoso al mismo tiempo.

Reiji y Cal salen a buscar ropa antes de que él comenzara a entrenarla en armas de fuego cuando Lizzie le dijo que McGuire deseaba obtener detalles sobre el entrenamiento de Cal. Mientras tanto, Claudia le dice a Reiji que planea usar a Godoh y sus secuaces para acabar con Isaac, ya que cree que él es el responsable de los tiroteos en Los Ángeles. Reiji sigue al grupo Godoh en Las Vegas antes de encontrar a uno de los secuaces del grupo asesinado en su habitación de hotel en Las Vegas. Reiji persigue al supuesto asesino hacia el ascensor cuando vislumbró al supuesto asesino, quien cree que es Ellen.

Godoh está furioso por el asesinato de sus hombres una vez más y exige una explicación y Claudia le promete que hará todo lo que esté a su alcance para descubrir a los culpables. A Reiji se le asignó la tarea de localizar a los culpables de matar a los subordinados de Godoh.

Para apaciguar a Godoh, Claudia dispara y mata a Isaac como el responsable del ataque del francotirador. Más tarde, Reiji le confía a Lizzie que el ataque ocurrió después de que mataran a Randy Weber, lo que significa que no era parte del plan de Isaac. Reiji planta el dinero que Cal robó en la mansión de Wisemel para implicarlo aún más en su traición. Cal se ofrece a ayudar a Reiji en sus asesinatos, no quiere que ella se involucre más, pero Cal todavía quiere ayudar a Reiji, ya que se siente aislada porque Reiji está solo en este estilo de vida asesino. Cal quiere ser Reiji, con él para siempre.

Reiji se va del apartamento, mientras que Cal está decepcionado y Reiji promete que volverá. Al llegar a la cita, Reiji se da cuenta de que es una trampa de Godoh y sus hombres. Cuando Reiji intenta convencer a Godoh del malentendido, el líder yakuza cree que Claudia ha engañado a su banda. Godoh revela que Claudia lo envió a él y a Shiga a robar la cocaína hace un año. Después del robo de drogas, el trato de Claudia fue hacer que el grupo de Godoh se uniera a Inferno.

Reiji mata a los hombres de Inferno que bombardearon su apartamento y escapa. Scythe Master y Shiga le explican toda la situación a McGuire, atribuyendo la traición a Claudia y Phantom. Claudia llama a Reiji para contarle el motivo de su traición y necesita su ayuda para escapar. Elen va a matar a Reiji por orden de Scythe y Scythe revela la próxima generación de asesinos que está creando: Zahlen Schwestern y revela que Ellen ya no es necesaria. Claudia y Lizzie se encuentran y conducen hasta la playa, donde Lizzie se ve obligada a ejecutar a Claudia por su traición.

Todo el episodio es un resumen de la vida de Cal con Reiji con algunas escenas adicionales. Mientras el departamento de Reiji fue bombardeado por el ataque de Inferno, Cal estaba de compras en una tienda. Durante unos días, Cal permaneció en las ruinas del apartamento esperando que Reiji regresara, pero nunca volvió a aparecer, ya que ahora está huyendo con Ellen. Scythe Master se le aparece a Cal y la anima a creer falsamente que Reiji la ha abandonado y ha roto su promesa. Mientras tanto, Reiji y Ellen se han dirigido a las afueras de México.

Han pasado 2 años desde que Reiji y Ellen escaparon de Estados Unidos y se establecieron en un pequeño pueblo de Japón. Intentan vivir sus vidas con normalidad y se matriculan en la escuela. Un día, Reiji es arrastrado por uno de sus compañeros de clase, Sanae, para encontrarse con su amiga Mio Fujieda, quien intenta confesarle sus sentimientos. Después de una conversación incómoda, ambos acuerdan tener una cita.

Reiji le dice a Ellen que Cal está vivo y que trabaja para Inferno como asesino, culpándose a sí mismo por haber introducido a la niña en el inframundo. Inferno ayuda al grupo Godoh a deshacerse de una mafia china rival para que no establezca un punto de apoyo en la región. Cuando los agentes comienzan a actuar, Scythe envía a Cal para colarse en la reunión de las mafias y matarlos a todos.

Después de intercambiar formalidades, Ellen y Cal sacan sus armas, lo que lleva a un encuentro parejo entre los dos. Reiji llega e intenta persuadir a Cal para que ponga fin al enfrentamiento, pero ella se niega. El enfrentamiento termina cuando Lizzie interrumpe y logra convencer a Cal de que se vaya. Lizzie deja ir a Reiji y Ellen, pero les advierte que Inferno no los dejará ir tan fácilmente. Reiji llama a Shiga y lo amenaza usando a Mio para aconsejar a Inferno que no intente nada. Durante su conversación con Lizzie, Cal revela sus pensamientos oscuros y las razones para ser una asesina.

Ellen y Reiji reanudan su "vida normal" como estudiantes una vez más hasta que Cal visita personalmente a Mio. Cal le dice que la acompañe y se encuentra con Lizzie. Sin embargo, apunta con su pistola a Cal y le dice que se aleje de Mio. Después de burlarse de Lizzie sobre si realmente le dispararía después de sacar el reloj de bolsillo que Reiji le dio a Cal hace años cuando tenía el nombre en clave Phantom by Inferno, Cal apunta y dispara a Lizzie antes de irse y dejarla morir. Reiji recibe un mensaje telefónico con amenazas de Cal. Mientras tanto, Shiga visita a Scythe y le grita enojado por haber arrastrado a Mio a este lío después de ver los cadáveres de sus hombres en la residencia de Mio. Scythe le asegura a Shiga que él mismo se encargaría de Cal, informándole que había convocado refuerzos para solucionar el problema.

Reiji le dice a Ellen que se encargará personalmente de Cal. Aunque Ellen le permite pensar en ello, sale temprano de la escuela sin informar a Reiji. Luego le envía un mensaje de voz a Reiji, diciéndole que escape sin ella y promete alcanzarlo una vez que haya rescatado a Mio. Bajo cautiverio, Mio intenta convencer a Cal de que Reiji no es lo que ella pensaba que era, pero Cal no escucha. Sin embargo, en el fondo, todo lo que Cal realmente quiere es el amor de Reiji.

La madre de Mio finalmente le dice la verdad sobre su herencia y que su padre está vivo, y le explica que su separación era la única forma de preservar recuerdos felices juntos. Mio, al darse cuenta de lo que siente por Reiji, lo llama para contarle sobre el duelo entre Cal y Ellen y también dice que esperará a que él regrese una vez que esté feliz. Cal llega a la iglesia y encuentra a Reiji allí para el duelo en lugar de Ellen.

Reiji y Elen derrotan a Zahlen Schwestern después de una batalla difícil y Elen finalmente se libera de las manipulaciones mentales de Sythe Master y puede matarlo. Mientras tanto, en Estados Unidos, se le pide al Sr. McGuire sus órdenes con respecto a Phantom y reflexiona sobre los logros de Ein y Zwei para Inferno. Afirma que la juventud debe prevalecer sobre el viejo sistema y que Inferno debe continuar; se desconoce si esto significa que Ein y Zwei deben ser eliminados como parte del "viejo sistema" o ser recuperados como "jóvenes".