Una nueva amenaza surge cuando el villano encapuchado se libera y un autobús lleno de experimentos fallidos, con los criminales y mutantes. Una vez libre, comienza a buscar a los restantes miembros de los Rebeldes Omega en busca de la última via de suero de inteligencia. Dr. Necros viene a buscar a Aaron Stone por protección, pero en cambio los atrae en las garras de los malos. Mientras tanto, Jason está decidido a conseguir un trabajo para Charlie trabajando en Comics Sin Fin.

Charlie descubre que su padre trabajaba para los Rebeldes Omega, mientras trata de demostrar que su padre no era malo. Charlie sigue las pistas dejadas por su padre para encontrar el suero de inteligencia. Con las nuevas amenazas para el mundo, Hall alista Vas y Ram para crear un paquete de expansión de Hero Rising que incorpora los nuevos villanos para ayudar a entrenar a Charlie por su inevitable confrontación con este nuevo mal. Mientras tanto, Jason se hace pasar por Charlie para que empiece a trabajar en Comics Sin Fin.

Cuando Jason accidentalmente vende el guante, Aaron debe enfrentar grilletes sin su arma de confianza. Mientras tanto, un delincuente utiliza el guante para robar un banco.

Aaron es fotografiado mientras detiene un robo de coches blindados, forzándolo adejar que el señor Galápagos escapara cuando había más cámaras presentes. Mientras tanto, Jason, y una compañera de clase que está enamorada de él empiezan a preguntarse quién y lo que Stan realmente es.

Aarón es detenido para ser interrogado cuando aparentemente secuestra T. Abner Hall y debe convencer a Stan y a Dark Tamara que no era él, pero fue el Mutante U, quien tiene la habilidad de cambiar de forma.

Aaron Stone es asignado para proteger a la hija de un dignatario extranjero importante, pero ella es secuestrada por Steeltrap; Aaron debe tratar de encontrar la manera de salvarla, pero su plan no se hace sin un consejo inesperado.

Al tratar de detener a una fugitiva del Sector 21, Colmena, de convertir el mundo en zombis, Aaron Stone transportaunos insectos Zombie Africanos que contienen el veneno de Colmena para controlar la mente a Eastland. Los insectos entran al sistema de Stan y terminan infectando a Jason y media de la escuela. Aaron debe obtener una muestra del veneno de la colmena a Emma para que ella pueda hacer un antídoto antes de que sea demasiado tarde.

Elías Powers se escapa de la cárcel de máxima seguridad del Sr. Hall, secuestra a Dark Tamara y desafía a Aaron a un juego de alto riesgo para encontrarla. Aaron tiene que descifrar las pistas misteriosas que Powers deja mientras evita los rayos láser por satélite dirigidas a él. Mientras tanto, Jason es chantajeado por Megan para ganar entradas a un concierto a cambio de ser su novio. Pero cuando Jason se niega sus demandas, debe competir con Eugene para ganar los boletos.

Aaron y Dark Tamara van de incógnitos en una escuela preparatoria privada para averiguar quién es el responsable de convertir a los estudiantes en super ladrones. Mientras tanto, Jason encuentra el libro de armas secretas de Emma, disfrazado de su diario, y trata con todos los medios que pueda para abrirlo.

Demente está harto de que Aaron Stone arruine sus planes y envía un cazarecompensas de alta tecnología llamado Trace a que lo atrape. Mientras tanto, Charlie se las arregla para llamar la atención del entrenador escolar mediante el uso de sus zapatos X5 en el salto de longitud.

Los planes de Charlie para pasar tiempo a solas con Carrie ver su película de terror favoritas se ven frustrados cuando Hybrot, la computadora liquida de Demente que puede robar y guardar memorias se atraviesa en su camino. Charlie debe encontrar una manera de apagar el Hybrot, obtener los recuerdos de Emma, Vas, Ram, Carrie y Jason, todo sin revelar su alter ego a Carrie y Jason.

Charlie se ve obligado a posponer su cita con la animadora Irina Webber cuando un nuevo y mejorado el Sr. Galápagos vuelve a robar la batería de fusion. Mientras tanto, Jason invita a un grupo de chicas de la escuela a dar un paseo en el coche de nuevo de Charlie.

Charlie pierde su primer juego en Hero Rising contra un jugador nuevo llamado The Grudge, un adolescente entrenado por Elías Powers. The Grudge está trabajando con los Demente para destruir a Aaron Stone y liberar un virus mortal en el mundo, y cuando Demente, U y Elías Powers capturan al Presidente de los Estados Unidos, pero otro asunto es cuando Jason ve que Vas, Ram, Ema y Charlie van a un lugar en la tienda siempre en el mismo lugar hasta que descubre a su hermano, ahora Aaron Stone debe infiltrarse en la Casa Blanca, liberar al presidente y sin dejar detener a los mutantes antes de que sea demasiado tarde.

Charlie pierde su primer juego en Hero Rising contra un jugador nuevo llamado The Grudge, un adolescente entrenado por Elías Powers. The Grudge está trabajando con los Demente para destruir a Aaron Stone y liberar un virus mortal en el mundo, y cuando Demente, U y Elías Powers capturan al Presidente de los Estados Unidos, pero otro asunto es cuando Jason ve que Vas, Ram, Ema y Charlie van a un lugar en la tienda siempre en el mismo lugar hasta que descubre a su hermano, ahora Aaron Stone debe infiltrarse en la Casa Blanca, liberar al presidente y sin dejar detener a los mutantes antes de que sea demasiado tarde.