Tom Jackman sufre transformaciones extrañas a una versión de sí mismo animalizada y más fuerte. Para manejar la situación contrata a una asistente, Katherine Reimer, quien debe observar lo que necesitan él y su álter ego. Más tarde descubre que su esposa Claire había contratado a una detective, Miranda Calender, para que averiguase por qué la había abandonado. Calender consigue revelarle a Jackman que al parecer es el último descendiente vivo de Henry Jekyll, y que son idénticos físicamente, pese al hecho de que Jekyll jamás tuvo hijos. No logra averiguar quién más está observándolo. Mientras tanto, Hyde continúa volviéndose más fuerte y se muestra el tercer bando, a través de Benjamin.

Tom decide averiguar quién es, conoce a su madre (quien lo había abandonado de niño) y descubre que una organización se encuentra en la búsqueda de Hyde para un objetivo que no logra comprender.

Tom regresa a su hogar, y descubre que la organización que lo persigue es 'Klein & Utterson', la compañía para la que trabaja. Hyde asesina a Benjamin — uno de los líderes de la organización — y los ejecutivos de Klein & Utterson se lo llevan y lo colocan en una caja cerrada, pese al hecho de que están al tanto de su claustrofobia.

Cuando la detective privada enfrenta a Klein & Utterson con la teoría de que Tom es el clon de Jekyll, un viejo amigo de Jackman, Peter, revela que no saben qué viene a ser Tom. Por otra parte, los recuerdos de Hyde muestran cómo se habían conocido Tom y Claire y los primeros "despertares" del álter ego.

Se cree que Tom está muerto y que Hyde tomó el cuerpo por completo, ya que Tom parece haber sucumbido al terror causado por la claustrofobia. Al navegar en los recuerdos de Tom, Hyde encuentra la memoria genética de Henry Jekyll, y descubre que éste jamás había utilizado una poción (algo que todos daban por hecho, y que, evidentemente, planeaban reproducir los ejecutivos de Klein & Utterson). También descubre que el ama de llaves de Jekyll luce exactamente igual que Claire poco antes de que Klein & Utterson la abduce a ella y a sus hijos.

Una vez que Tom y Hyde combinan totalmente sus personalidades (Tom necesita la fortaleza física de Hyde, mientras que Hyde requiere la madurez emocional de Tom), se revela que Claire es un clon del ama de llaves de Jekyll y que había sido creada para estimular la transformación en Tom, ya que el amor por el ama de llaves había estimulado la transformación en Jekyll. Tom, por su parte, es un descendiente de los hijos ilegítimos de Hyde. Hyde muere protegiendo a los hijos de Tom, negándose a "compartir el daño" con su otro yo después de recibir un disparo. Los hijos de Jackman parecen haber heredado parte de los genes familiares de Jekyll/Hyde. Finalmente, se revela que la mujer estadounidense de Klein & Utterson es la versión 'Hyde' de la madre de Tom Jackman, de la cual había heredado los genes de Hyde.