Bang se encuentra huyendo de un bandido que conduce un Guysack, llega hasta unas ruinas y se oculta en ellas. Otros dos bandidos disparan contra las ruinas y esto abre una entrada secreta, donde Bang descubre un organoide al que llama Sieg en recuerdo del zoid de su padre. Luego aparece un bandido y los ataca, por lo que Sieg vuela junto a Bang hacia el desierto y reviven a un Shield Liger, con el que derrotan a los bandidos. Sieg siente algo dentro de las ruinas, regresan a ellas y descubren una niña.

El líder de los bandidos Deserto Arcobaleno, Rosso, es informado acerca del organoide Sieg, por lo que ordena a Viola y sus hombres capturarlo. Bang descubre que la niña que encontró se llama Fine y que tiene amnesia, y la lleva a su casa junto a su hermana Maria. Más tarde los bandidos atacan el pueblo, y capturan a la hermana de Bang, hasta que entreguen a Sieg. Los pobladores detienen a Bang y Sieg es llevado donde los bandidos. Liberado Bang, se dirige donde los bandidos y los derrota. Más tarde se va del pueblo para evitar futuros ataques.

Bang y Fine se pierden en el desierto y son rescatados por Irvine. A la mañana siguiente él se ha ido y se dirigen a un fuerte en ruinas, donde son atacados por un Gordus abandonado durante la guerra que aún protege al fuerte. Irvine aparece y daña al Gordus, y Bang se encarga de cuidarlo. Más tarde Fine lee en un pilar unas extrañas letras, que hablan del “Zoids Eve”. Irvine vuelve a aparecer y los ataca. Luego Bang lucha contra él en el desierto, y cuando está a punto de perder, Gordus aparece y lo protege. Irvine huye y Gordus regresa al fuerte.

Bang llega a un pueblo en problemas con los bandidos, y trabajará ahí como guardaespaldas junto a Irvine. Más tarde llegará el equipo completo de Deserto Arcobaleno, incluido el líder Rosso, a atacarlos. Irvine se encargará de derrotar a los Molga y el Redler de Viola, y Bang deberá luchar contra el Red Horn de Rosso y dos Command Wolf. Bang hallándose en desventaja numérica utiliza las napas subterráneas que Fine puede ubicar, para hundir a sus enemigos en un cráter y derrotarlos.

Mientras viajan por el desierto se cruzan con Moonbay, una conductora encargada de transportar cargas. De pronto son atacados por un grupo de Guysack, pero aparece Irvine y los rescata. Moonbay encuentra unas ruinas para descansar y poder reparar a los Zoids dañados. Irvine explica que los Guysack eran “Sleepers” programados por el ejército para intersectar enemigos, en este caso, el cargamento de municiones de Moonbay, que era para el Imperio. Durante la noche son nuevamente atacados por Sleepers, y mientras batallan, Moonbay suelta la carga para que puedan escapar. Al final Irvine se va, pero Bang viajará ahora junto a Moonbay como su guardaespaldas para pagar la pérdida de su carga.

Cuando llegan a Río Rojo, lugar entre las naciones imperial y la republicana, son detenidos por Rob Herman, comandante del ejército republicano y el teniente O'Connell, confundiéndolos como espías del imperio, pero Sieg logra escapar. En prisión se encuentran con Irvine. Cuando Sieg regresa para rescatarlos, Bang y Irvine logran escapar y derrotan al capitán Herman y dos de sus soldados que conducían Pteras. Mientras tanto Moombay y Fine son liberadas y firman un contrato con el teniente O'Connell, prontas a una batalla con el Imperio.

Bang, Fine y Moonbay son contratados por el ejército republicano. El conflicto en Río Rojo se debe a la presencia del Imperio y posterior defensa de la República en aquella zona neutral. Las intenciones del Comandante en Jefe del Imperio, Proitzen, son las de atacar, pero el comandante imperial Teniente Karl Liechten Schwarz actúa templadamente, por lo que no se atacará hasta que la republica comience las hostilidades. Todo se mantiene en pausa hasta el ataque de un Pteras pilotado por Viola y que fue contratada por Marcus, el segundo al mando del imperio, para forzar la batalla. Moonbay y Bang se encargan entonces de destruir un puente para evitar que el imperio reciba refuerzos y así terminar con el conflicto.

Por recomendación del capitán Herman, se dirigen hacia la capital para buscar información sobre el Zoids Eve. Con Irvine ahora en el equipo, hacen una parada en la colonia Sand para restablecerse. En eso Bang y Moonbay son atacados y tomados prisioneros por los bandidos Deserto Arcobaleno, pero Irvine y Fine logran liberarlos y comenzar una batalla. Por primera vez Shield Liger usa su escudo mientras lucha contra Red Horn. Luego aparece el ejército imperial para detener a Rosso como responsable de la derrota en Río Rojo, y este al darse cuenta disuelve el equipo de bandidos para que sus compañeros puedan huir.

Luego de luchar contra unos Molga del Imperio, llegan hasta un valle donde actúa el “Rare Hertz”, una onda que altera el sistema de control de los Zoids, por lo que Sieg se vuelve agresivo y ataca a Gustav y a Command Wolf, toma posesión de Shield Liger y escapa. Bang va a buscarlo y al encontrarlo, trata de que hablar con él. Sieg es incapaz de dañarlo y escapa hasta un acantilado, y al retroceder cae, pero Bang logra atraparlo. El cuerpo de Bang cede, y justo cuando ambos caen por el acantilado Sieg logra liberarse del Rare Hertz y volar, salvándose ambos.

Bang, Fine y Irvine van a la montaña donde vive el Dr. D para saber si él tiene información sobre el Zoids Eve, mientras Moonbay baja al poblado. Cuando llegan lo encuentran congelado, y pasan ahí la noche. Al otro día el doctor los hace hacer varias tareas hogareñas, mientras él se dedica a construir una máquina para hacer que nieve en esa zona, su gran sueño. Luego de atacar una zona de abastecimiento del ejército republicano y robar materiales, un Guysack Sleeper sigue al doctor y destruye su casa. Al día siguiente entre Bang, Irvine y el Dr. D construyen una máquina/cohete para intentar hacer nevar. Sin embargo, a pesar de que el invento no funciona, comienza a nevar.

De camino a la república, llegan a la montaña Iselina. Bang se baja de Gustav y por salir a buscarlo Fine y Irvine se pierden en la neblina. Luego Bang regresa al Gustav, y junto a Moonbay se cruzan con una chica, Rosa, que los guía a su pueblo en la montaña. Rosa le explica a Bang que su hermana mayor dejó el pueblo para convertirse en soldado imperial y buscar la paz. En ese instante aparece Viola y Giallo para vengarse de Bang. Ambos son derrotados, pero en un momento aparece Rosa, que reconoce a Viola como su hermana. Bang para evitar que Rosa se decepcione de la condición de bandido de su hermana, finge ser él el bandido que está siendo perseguido por soldados del imperio y huye junto a Moonbay. Más tarde se disipa la niebla y encuentran a Irvine y Fine.

Una legión de Guysack fue destruida por un chico con un organoide negro. Cuando Bang y los demás llegan a esa zona, lo confunden y tratan de detenerlos, pero Bang y Fine logran escapar. En prisión, Irvine y Moonbay son liberados tras descubrirse que trabajaron para el capitán Herman. Mientras Bang y Fine se esconden, conocen a Raven y luego de verse frente a un batallón de Godos, Raven decide eliminarlos con su Sabre Tiger. Irvine, Moonbay y Sieg aparecen y junto a Bang tratan de detener a Raven, pero son derrotados. Luego este se retira tras recibir una llamada del Imperio.

Molesto por su derrota, Bang desea volver a pelear contra Raven, a pesar de la negativa de Fine y Moonbay. Al otro día reta a Raven a un combate, donde interviene Irvine, aunque es vencido rápidamente. En eso Bang reorganiza sus fuerzas, ataca a Raven con el escudo y lo derriba. Luego Raven utiliza el poder de su organoide Shadow para vencer a Bang y se retira. Por otra parte Marcus se adelanta a Schwarz y manda a sus tropas atacar el Fuerte Cronos, sin saber que lo esperaba una trampa del coronel Krueger, que destruye a sus tropas.

Sieg queda en coma luego de la batalla con Raven. En el pueblo encuentran al Dr. D, que le dice a Bang que para curarlo necesita la roca “Zoids Magnite” que se encuentra en el interior del volcán del monte Osa, por lo que Bang y Moonbay van a buscarla. Luego el doctor le dice a Irvine que pida en su nombre un arma para poder luchar contra Raven. Cuando Irvine enfrenta a Raven, la nueva arma destruye una de las piernas de Sabre Tiger, pero con el poder de Shadow, Irvine es derrotado y escapa. Más tarde Bang logra darle la roca a Sieg y este comienza a recuperarse.

Sieg aún sigue en recuperación. Entretanto el capitán Herman llega a la base del monte Osa y conduce el Gojulas, la última arma del ejército republicano, contra las tropas del Imperio que acaban de llegar, obligándolos a retirarse. Bang preocupado por Irvine que se encuentra en la base republicana, va en su búsqueda y logra utilizar el escudo de Shield Liger sin necesidad de tener a Sieg. Al final, Sieg ya luce recuperado.

Cuando llegan a la capital republicana, ciudad de Nueva Helic, Bang ayuda a un soldado imperial que iba a ser linchado. Debido a esto son perseguidos y, junto al Dr. D, hechos prisioneros. Luego la presidenta de la república los visita y, al reconocer al Dr. D, son liberados. Más tarde el fugitivo roba un Command Wolf y ataca la ciudad dejando varias víctimas, pero es derrotado por Bang, que se culpa de lo ocurrido. Por otra parte el capitán Herman (que resultó ser el hijo de la presidenta), pilotea un Pteras por tareas de reconocimiento de un extraño iceberg, que reconoce como del imperio, y es derribado.

El paradero del capitán Herman es desconocido, por lo que Moonbay y su equipo son contratados para buscarlo. Herman logra nadar hasta la capital y encontrarse con ellos, para alertar que el iceberg pertenece al Imperio, y que el ataque principal del enemigo se realizará desde el mar y no desde el monte Osa. Irvine, Moonbay y Fine se encargan de comunicar a las tropas del monte Osa que se dirijan a la costa, mientras Bang conduce a Herman a la base costera para preparar la defensa, pero son interceptados por Raven. Gracias a las instrucciones de Herman, Bang logra combatir al mismo nivel de Raven, aunque se interrumpe la batalla cuando comienza el ataque del Imperio.

El ejército republicano debe hacer frente al ejército imperial que desembarca en ciudad de Nueva Helic, y Proitzen trata de negociar la rendición total de la República. Mientras tanto Fine, Moonbay y el coronel Krueger continúan en la fortaleza del monte Osa, por lo que Bang y el Dr. D van en su búsqueda. En ese lugar aparece Raven, que comienza otro enfrentamiento con Bang, en el que Saber Tiger es destruido, debiendo escapar Raven. Luego logran destruir el volcán y forzar la retirada del Imperio de monte Osa, muriendo también el Mayor Marcus. En ese momento fallece el emperador Zeppelin II, asumiendo el puesto su nieto, Rudolph Gerhard Zeppelin III, que ordena el término del ataque contra la nación republicana.

Bang y los demás se dirigen a las ruinas de Gurreal en busca del Zoids Eve. Mientras, Rosso es liberado de prisión por sus compañeros, para luego planear secuestrar al príncipe Rudolph. Por otra parte Proitzen contrata unos sicarios para que eliminen a Rudolph simulando ser un ataque de la República, pero su misión es frustrada por Rosso, que finalmente logra secuestrar al príncipe.

Rudolph se mantiene con Rosso. Luego los sicarios de Proitzen intentan tenderle una trampa a Rosso, pero son descubiertos y sus zoids destruidos. Al mismo tiempo, Bang y sus compañeros se llegan a las ruinas de Gurreal. Mientras las exploran son atacados por Rev Rapter “Sleepers” que protegen las ruinas, pero son derrotados por Shield Liger. Continuando la búsqueda se dan cuenta de que solo queda un fragmento de un antiguo monumento de piedra, y Fine al tocarlo logra recordar al “Death Saurer”. Al final Proitzen le regala un nuevo zoids a Raven, llamado Geno Saurer.

Rudolph se siente agradecido de los cuidados de Rosso y Viola, por lo que sale a buscarles alimentos, y al perderse se encuentra con Bang y sus compañeros. Ellos le ayudan a conseguir la comida, pero de pronto son atacados por Raven y su Geno Saurer, que derrota al Command Wolf e incluso el escudo de Shield Liger es fácilmente penetrado. Cuando Raven se preparaba para dar el golpe final con el cañón de partículas eléctricas, aparecen Rosso y Viola en el Iron Kong para detenerlo. Bang y los demás aprovechan ese momento para escapar y el Iron Kong es destruido.

Proitzen, que planea apoderarse del Imperio, organiza un escuadrón de búsqueda del príncipe, pero al mismo tiempo ordena secretamente a Raven que se deshaga de ellos. Mientras, Rudolph le pide a Bang que le enseñe a conducir zoids. Más tarde, cuando encuentran restos de zoids destruidos aparece el Dr. D que se encontraba investigando. Al anochecer Rudolph planea escapar para evitarles problemas, pero es detenido por Bang y Fine. En ese momento aparece Shadow que toma como rehén al príncipe para que Bang no pueda evitar el combate con Raven. Durante el combate el Geno Saurer lanza un disparo que destruye el “Zoids Core” (la parte más vital y corazón del zoids) de Shield Liger, matándolo.

Después del ataque del Geno Saurer, Sieg carga a Bang en su interior para protegerlo. Luego Raven hace entrega de Rudolph a los sicarios de Proitzen y se va. Ellos se dan cuenta de que a Rudolph le falta el anillo que Proitzen necesita para probar su muerte, por lo que se comunican con Irvine para que les lleven el anillo. Irvine y Bang van en su encuentro, toman a Rudolph e intentan huir, pero son acorralados en una mina. Cuando salen aparecen los villanos nuevamente en sus Dark Horn, pero Irvine consigue derrotarlos. Al final, Fine siente una extraña voz, y junto con Sieg entra en el Shield Liger muerto, formando un extraño capullo de luz.

Stinger, un famoso caza recompensas le ofrece ayuda los sicarios de Proitzen. Entretanto Bang, molesto por la decisión de Fine y Sieg de entrar en Shield Liger y dejarlo solo, se aleja hasta llegar a unas ruinas, donde reflexiona y recuerda su encuentro con Sieg y Fine. De pronto escucha la voz de Fine, y decide dejar de lamentarse. Paralelamente, Stinger se hace pasar como una víctima que es perseguida por unos villanos y le tiende una trampa a Moonbay, Irvine y Rudolph, dejándolos paralizados con una toxina, con excepción de Rudolph, que escapa. Finalmente, mientras Bang regresa donde sus compañeros, es perseguido por uno de los sicarios.

Irvine, Moonbay y Rudolph fueron capturados por Stinger. De pronto aparece el Dr. D dentro de un traje robótico que usaba para investigar el capullo de luz, y libera a los rehenes. Al mismo tiempo, Bang logra robarle el Guysack a uno de los sicarios y llegar hasta donde Stinger, pero éste usa su Great Saber para derrotarlo. Entonces Bang arremete contra Stinger en su skate aéreo, pero de un solo disparo es lanzado dentro del capullo. De allí dentro renace un nuevo Liger que despertó por los sentimientos de Bang, y utilizando sus hojas de un solo corte derrota a Stinger. El nuevo zoids es nombrado Blade Liger. A pesar de todo, el anillo de Rudolph es robado por el líder de los sicarios. Finalmente Bang se reúne nuevamente con Fine y Sieg.

Proitzen, ahora regente del Imperio, anuncia frente a los ministros la muerte del emperador Rudolph a manos de la República. Mientras tanto, Fine confiesa al Dr. D que ha recuperado parte de su memoria tras haber entrado en Sieg, pero que debido a que Bang entró antes en él, no ha podido recuperarla por completo. Por otra parte, los hermanos Crossbone, unos caza recompensas, escuchan de Stinger la existencia del organoide Sieg, y se dirigen en su búsqueda. Usando sus Heldigunner capturan a Sieg y ponen en dificultades a Bang, pero gracias a las oraciones de Fine, Sieg logra liberarse, entrar en Blade Liger y derrotar a los enemigos. Paralelamente, Raven destruye un fuerte republicano y captura los Zoids Core de los zoids vencidos a petición de Proitzen, para ser usados en un misterioso zoids.

Bang y sus compañeros intentan llegar a Guylos con Rudolph, pero el ejército imperial ya se encuentra realizando las labores de búsqueda de este. Debido a esto, uno de los caminos se encuentra bloqueado, necesitando pasar a través montañas para avanzar, pero mientras lo hacen son descubiertos y encarcelados. Sin embargo, unos de los soldados imperiales era aquel que Bang anteriormente había salvado de ser linchado en ciudad de Nueva Helic, y este al reconocerlos los libera, debiendo renunciar ahora al ejercito. Bang y sus compañeros continúan su escape hasta el desierto y ahí derrotan a las tropas enemigas, logrando escapar.

Bang y sus compañeros llegan a un pueblo que tiene problemas con bandidos, y donde ayudan a un niño en dificultades. Luego conocen el hogar donde vive, y ahí se encuentran con muchos niños que sufren de una peligrosa fiebre, que según palabras de Irvine es mortal en pocos días. Este detalle es conocido por él debido a que cuando era niño, su hermana pequeña, Helena, murió de esta enfermedad. En este lugar la medicina ha sido saqueada por los bandidos, por lo que Bang y Irvine van en su búsqueda y logran traerla, salvando a los niños. Al final se muestra una victoria de Raven frente a soldados republicanos.

Mientras viajan, deben decidir si seguir por un camino corto pero que se cruza con una pequeña base imperial, o elegir el camino más largo a través de la montaña. Bang, Fine y Rudolph van por el camino corto, pero no saben que la base ha sido ampliada con nuevos y mejores Redler de las tropas Einsen Beck del Mayor Ralph. Cuando llegan hasta ella son atacados, sin embargo Rudolph se comunica con la base y es reconocido por el Mayor Schwarz, y debido a eso es detenido como traidor. Bang y los demás se encuentran en desventaja, pero son rescatados por los misteriosos Barones de Alas y sus Storm Sworder, que recibieron del Dr. D y el capitán Herman, logrando derrotar a los Redler enemigos y retirándose luego.

Bang y sus compañeros huyen del los soldados imperiales hasta llegar al territorio de McMahon, un millonario que con su influencia detiene a los del imperio. Luego descubren que McMahon era la antigua pareja de Moonbay, y se refugian en su mansión. El capitán imperial decide allanar la mansión, pero se ve imposibilitado ante McMahon. Los chicos al darse cuenta de que la relación de Moonbay aún puede continuar, deciden dejarla atrás, pero la pareja se niega. Finalmente un último intento del capitán por detener a Rudolph fracasa, se despiden de McMahon y continúan su viaje a Guylos.

La Ciudad del Viento es atacada por uno de sus propios tenientes imperiales. Al observar esta falta, los legendarios Tres Caballeros deciden castigarlos, derrotando a la flota fácilmente. Más tarde el Mayor Ralph aparece frente a ellos para darles la misión de derrotar al Blade Liger. Bang y sus compañeros cruzan el Valle del Héroe, y llegan a aquella ciudad que ahora se encuentra en reconstrucción, pero son retados a batallar por los Tres Caballeros que recibieron la misión desde Guylos. La batalla comienza con Irvine, que empata con Grosskopf. Luego Bang vence con dificultades a B.P. Durante la ultima batalla, se encuentra a punto de ser derrotado por Wagner, pero éste se distrae al reconocer a Rudolph, momento que es aprovechado por Bang para vencerlo.

Bang y sus compañeros llegar a Guylos y se encuentran con el primer ministro Homalev, que les da posada y les comenta que Proitzen busca al Zoid EVE, por lo que durante la noche Bang y Fine van en su búsqueda. Proitzen se presenta ante ellos, pero la presencia de Fine hace que el Death Saurer de Proitzen despierte, debiendo escapar. Durante la mañana una tropa imperial aparece frente al ministro Homalev, debiendo pedir este ayuda a la República, mientras tanto Bang se prepara para enfrentarse nuevamente a Raven.

Bang lucha contra Raven, pero es superado y gravemente dañado, siendo Fine y Sieg expulsados del Blade Liger. Luego Bang recobra las fuerzas y ataca nuevamente al Geno Saurer, logrando dañarlo. Finalmente durante el último ataque de Raven, Fine y Sieg se unen al Blade Liger para ayudar a Bang y logran destruir al Geno Saurer. Mientras tanto Rudolph, Moonbay, Irvine y Homalev deben luchar contra tropas imperiales de Hardin, y viajar hacia a la ceremonia de coronación de Proitzen.

Los Barones de Alas aparecen para ayudar a Rudolph a llegar hasta donde Proitzen, mientras Irvine, Moonbay y Homalev son rescatados por las tropas republicanas, que destruyen a las tropas de Hardin. Proitzen mientras tanto presenta ante su pueblo al Death Saurer, y se dispone con este a dominar su nación y la República, pero Bang y sus compañeros, en conjunto con las fuerzas republicanas y las tropas del Mayor Schwarz intentan detenerlo. El cañón de partículas eléctricas destruye fácilmente a tropas completas de zoids, por lo que es necesario elaborar un plan para detenerlo. Todas las tropas intentan distraer al Death Saurer y los Barones de Alas detendrán el ventilador que recolecta las partículas eléctricas, mientas Bang se encargará de dar el golpe final. El ventilador vuelve a funcionar, pero aún así Blade Liger logra atravesar y destruir al Death Saurer. Más tarde, durante la ceremonia de coronación de Rudolph, Bang y Fine se alejan para reiniciar su búsqueda del Zoid EVE.

Han pasado dos años desde la destrucción del Death Saurer. Bang, quien había estado entrenando en el ejército republicano, decide ir a visitar su pueblo. Por otra parte, Fine se encontraba explorando ruinas junto al Dr. D, pero ahora se dirige hasta el pueblo de Bang en busca de un médico para el doctor. En eso Fine y el pueblo son atacados por un Stealth Viper, pero Bang y Sieg logran derrotarlo. Aquel zoid serpiente había sido enviado por un extraño hombre llamado Hiltz, que se convierte en una nueva amenaza para el Imperio y la República. Bang y Fine, juntos nuevamente, formaran parte ahora de la Fuerza Guardián, para preservar la paz.

Bang y Fine llegan a hasta un pueblo, al que también llegan unas tropas imperiales que supuestamente están en búsqueda de explosivos. Bang conoce al capitán de las tropas, sin embargo más tarde es advertido por un policía republicano que aquel capitán está buscando y tratando de robar un tesoro republicano. Deciden entonces reunirse con las tropas a esperar que encuentren el tesoro para detenerlos. Sin embargo durante la batalla, el policía y el capitán, que enrealidad eran socios, simulan su muerte. Bang, quien ya se encontraba enterado de esto, los encuentra y luego los derrota.

El capitán O'Connell encuentra unas ruinas en un poblado, y Bang con Fine se dirigen a investigarlas. Sin embargo las personas del pueblo y el capitán desaparecen. En una iglesia se encuentran con un niño, al que Fine cuidará mientras Bang investiga que sucedió. Aquel niño es en realidad el causante de lo sucedido, y utilizando sus poderes mentales y su organoide pone en apuros a Bang. Sin embargo Bang logra recuperar la confianza y derrotar a su oponente, pero este escapa.

Bang y Fine ayudan a un pueblo en problemas. Allí los ayudará el Teniente Thomas Richard Schwarz, hermano de Karl Schwarz, aunque su encuentro con este comienza mal, debido a que confunde a Bang con el enemigo. Aclarado su error, deberán luchar contra una manada de Command Wolf, que poseen un avanzado y extraño dispositivo que redirige los proyectiles. Derrotado el enemigo, hace aparición Karl Schwarz, quien le encarga a Bang y a Fine que instruyan a su hermano.

Bang, Fine y Thomas son contratados para solucionar un problema de bandidos en una frontera. Cuando van a investigar, se dan cuenta de que los enemigos son invisibles, y luego de realizar un desesperado ataque logran ahuyentarlos. Más tarde gracias a Beek, la IA creada por Thomas, logran identificar a los enemigos, unos Helcat, y seguirlos hasta su guarida en una cueva. Bang y Thomas tratan de detenerlos a mano armada, pero aparece su líder, Hiltz, y se ven reducidos. Sin embargo Fine y Sieg aparecen para rescatarlos, y huyen hasta el bosque. Los Helcat los persiguen, pero son derrotados. Cuando Bang y los demás regresan a la guarida, Hiltz y los demás ya habían abandonado la cueva, y se dan cuenta de que en las paredes aparecen extrañas imágenes del Death Saurer.

Un grupo de bandidos está cazando zoids sleeper, y Bang quiere detenerlos. Para esto se oculta dentro de un Rev Ravter que está siendo capturado, e ingresa a su base flotante en el interior de un Whale King. En ese lugar se encuentra con Irvine, que simulaba pertenecer al grupo de bandidos, para capturar a su líder y cobrar una recompensa. Luego de escabullirse a la guarida donde llevaban a los zoids, son capturados y descubren que experimentan con los Zoid Core para forzarlos a mutar. Pero entonces Sieg entra a rescatarlos. Luego, mientras combaten junto a Thomas, Fine libera a los zoids prisioneros, pero la nave despega y Bang sube a rescatarla. Ahí se da cuenta de que Hiltz estaba tras de todo, y mientras el Whale King es hecho estallar, Irvine en un Pteras los socorre. Más tarde se despiden de Irvine.

Lise toma dominio de una base militar imperial, y cuando el coronel Karl Schwarz se dirige a investigar, queda bajo su control mental. En aquella base unas válvulas de refrigeración fueron desactivadas, lo que causará la explosión de los misiles que ahí se encuentran, provocando un gran daño al las poblaciones circundantes, por lo que Bang y Thomas se dirigen allí. Lise, que ya estaba enterada de su presencia en la base, manda a Specular a secuestrar a Fine, a Karl a enfrentar a Thomas, y a los soldados imperiales a enfrentar a Bang. Luego de una complicada batalla en la que Thomas se ve superado, logra finalmente detener a Karl. Al mismo tiempo Bang logra vencer y llegar hasta donde Fine, mientras que Sieg abre las válvulas, evitando la explosión.

Raven, quien desde la última batalla con Bang se encuentra trastornado mentalmente, comenzó a robar zoids para atacar y destruir diferentes bases militares. Debido a esto, Bang y Thomas lo esperan en una base, decididos a enfrentarse con él. Durante la noche, Shadow aparece como señuelo, mientras Raven roba un Dark Horn, pero Bang y Thomas logran derrotarlo. En ese momento, mientras Raven y Bang cruzan miradas, logra recuperar el conocimiento y escapar junto a Shadow. Paralelamente, Hiltz y Lise planean incluir a Raven en sus planes.

Stinger y los Hermanos Crossbone planean vengarse de Bang y secuestrar a Rudolph que disfruta un día de descanso con él, además de Fine y Thomas. De pronto aparece Mary Ann, la prometida de Rudolph, quien al darse cuenta de los sentimientos de Thomas hacia Fine intenta ayudarle a declararse, aunque finalmente no lo consigue. Más tarde sufren el ataque de Stinger y sus compañeros, pero logran vencerlos. Al final del episodio, Raven, que ahora tiene un nuevo Geno Saurer, se aparece frente a Thomas y lo derrota.

Luego de la batalla con Raven, Thomas es encontrado malherido por Moonbay, que lo lleva a una base militar en la que se encontraban Bang, Fine, Irvine y el Dr. D, preparándose para luchar contra el Geno Saurer. El Dr. D consiguió augmentar la resistencia del escudo del Blade Liger contra el cañón de partículas eléctricas, estando listos para enfrentar a su enemigo. Al otro día Raven aparece, y Irvine es el primero en caer. Luego Bang arremete con su escudo, logrando resistir al Geno Saurer, pero Raven utiliza el cañón de partículas eléctricas en conjunto con su cañón láser, y derriba al Blade Liger. Antes del golpe final, Moonbay y su Gustav intervienen para proteger a Bang, y cuando todo parecía perdido, Shadow retira a Raven de la batalla, para más tarde comenzar el proceso de evolución del Geno Saurer.

Los exmilitares de las tropas Eisen Beak, Ralph y Müller se aliaron a Hiltz, e ingresan a la base militar donde se encontraba Herman y O'Connell, y con ayuda de Ambient roban dos nuevos Storm Sworder negros, invisibles a los radares. Sin embargo, como les hace falta un dispositivo para funcionar correctamente, necesitarán volver más tarde. Bang, Fine, Irvine y Moonbay llegan para esperarlos a su regreso. Utilizando pintura en sus disparos, logran hacer visible al Storm Sworder de Müller, para luego ser derrotado por Bang. No obstante, Ralph no se ve afectado, y cuando se encuentra a punto de vencer, aparecen en escena los Storm Sworder de Rosso y Viora, en compañía de Rudolph, y logran derrotarlo.

El Dr. D invita a Bang a una isla abandonada, donde le pedir que libere sus tensiones para mejorar sus habilidades en batalla. Además, en aquel lugar se encuentra realizando investigaciones sobre una antigua ciudad zoidiana hundida en el mar, que Fine reconoce como su pueblo natal. Ese día en específico, las ruinas emergerán de las aguas, siendo ideal par la investigación. Sin embargo, Lise utiliza un Hammer Head para poner en serias dificultades a Bang, y luego de derrotarla, aparece Hiltz, quien ya había saqueado las ruinas. Más tarde la ciudad vuelve a sumergirse.

Mientras Raven espera el resurgimiento de su zoid, es tomado detenido por Karl Schawrz. Se intenta interrogarlo sin resultados, y mientras tanto, Bang, Irvine y Thomas, en conjunto con las fuerzas imperiales y republicanas intentan destruir el capullo del zoid de Raven, sin buenos resultados. Se decide entonces esperar a que el capullo abra para atacarle, mientras Raven es trasladado al Imperio como resguardo. Cuando se abre el capullo aparece el nuevo Geno Breaker, que resulta ileso ante los ataques en su contra, y enseguida parte hacia donde se encuentra Raven, destruyendo muchas de las tropas en su contra. Tras esto, Irvine es el primero en arremeter contra él, pero es gravemente lastimado, y, luego de derrotar a Bang, Thomas y las tropas de Schwarz, Raven se retira.

El Command Wolf está herido de muerte, y Irvine le hace compañía en sus últimos momentos de vida. Mientras tanto, el Dr. D presenta un nuevo zoid, el Lightning Saix. Sin embargo durante una prueba fallida, queda dañado el banco de memoria de su Zoid Core, quedando inutilizable. Por otra parte, la única forma de rescatar al Command Wolf es transplantar su banco de memoria al Lightning Saix. Mientras esto sucede, la presidenta Louise, que se dirigía a una reunión de representantes de las naciones, es secuestrada y puesta dentro de un grupo de zoids dirigidos a atacar a Rudolph. Es entonces cuando Irvine, dentro de su nuevo zoids logra un exitoso rescate.

El coronel Halford aparece para diseñar un ataque estratégico contra Raven. Mientras Bang, Irvine y Thomas practican su estrategia, Lise hace copia de los datos obtenidos y visita a Raven para mostrárselos. Raven acaba con las simulaciones de los datos, y luego, cuando se dispone a matar a Lise, Shadow colapsa ante el poder de Geno Breaker. Es ahí cuando Lise aprovecha para debilitar a Raven y mostrarle su pasado. Allí se revela que fueron Ambient y Hiltz quienes asesinaron a los padres de Raven, Dan Freiheit y León quienes lo encontraron y cuidaron, y luego cuando Shadow es descubierto por Dan y su equipo, aparece Proitzen para quitárselos, y al no poder hacerlo por culpa de Halford, manda a destruir Colonia Wind, muriendo Dan al protegerla. Más tarde Raven es encontrado y entrenado por Proitzen, quien finalmente le obsequia a Shadow. Al despertar, Raven se encuentra con Hiltz, Lise y una extraña figura, para luego volver a alejarse junto a Shadow.

Fine aumenta la velocidad de Blade Liger, además le proporciona a Thomas y a Irvine un dispositivo para crear un escudo que los protegerá de las partículas eléctricas. Halford le ordena quitar las mejoras a los zoid, sin embargo se niegan. Raven aparece, y la estrategia funciona correctamente, sin embargo el Geno Breaker comienza a atacar desde el aire, y destruye las tropas de retaguardia. Thomas queda sin municiones, y Irvine sin energía. Es entonces cuando Bang intenta alejar a Raven de sus compañeros y atacar como cuando lo hizo con el Death Saurer, pero se ve superado por Raven, quien lo envía a un acantilado.

Luego de caer al acantilado, Bang, herido, es arrastrado por un río hasta llegar a un poblado pidiendo ayuda, pero todos escapan de él y se desmaya. Al despertarse, sus heridas han sido sanadas por Nico, un chico que ama los zoid y que tiene un Helcat, que Bang le enseña a conducir. Fine y los demás encuentran al Blade Liger y a Sieg, y al no ver a Bang, Thomas envía un mensaje a las tropas imperiales cercanas. El capitán que cuida la zona es un hombre corrupto, y animado por Lise, decide buscar y dar muerte a Bang. Para hacerlo amenaza al poblado, pero Bang aparece y lo protege. Al ver esto, las personas también protegen a Bang, y luego Irvine y los demás aparecen para derrotar a las tropas imperiales. En ese momento Lise intenta atacar a Bang por sorpresa, pero es detenida por Nico. Cuando Bang se dirige a las ruinas a agradecer a Nico, se entera de que él había muerto hace diez años tratando de proteger a una niña zoidiana.

Debido a la elevada capacidad como conductor de Bang, el Blade Liger ya no se encuentra a su nivel, por lo que se hacen pruebas para elevar su velocidad como compensación. Además de esto, Sieg intenta despertar su poder oculto para estar a la altura de Bang. La primera prueba de un turbo impulsor falla al explotar este. La segunda prueba la realiza Moonbay, pero también falla. La última prueba la realiza Bang, pero Hiltz lanza unos Gun Sniper en su contra. El Blade Liger comienza a fallar nuevamente, pero Sieg, quien ha despertado su poder, entra en Blade Liger y juntos consiguen un rendimiento optimo. Por último Ambient entra en un Gun Sniper, elevando su potencial momentáneamente, aunque es derrotado de todas formas por Bang.

Un grupo de antiguos aliados de Proitzen contratan a Phantom, un peligroso asesino a sueldo, para que elimine a Rudolph durante la tradicional carrera Gran Premio de Guylos, pronta a efectuarse. Moonbay, que participará en esta competencia, es apoyada por Irvine y el Dr. D, que tomó prestado un motor experimental del ejército imperial. Bang, Thomas, Rosso y Viora estarán encargados de proteger a Rudolph durante el evento. Phantom utiliza un Gun Sniper oculto en altamar para asesinar a Rudolph, pero es descubierto, y escapa hasta al estadio. Mientras tanto en la carrera, Moonbay queda en segundo lugar tras ser vencida por un novato, El Enmascarado. Cuando Phantom se dispone a matar a Rudolph, se da cuenta de que lo que veía era una imagen tridimensional, y que el verdadero Rudolph era El Enmascarado, siendo detenido. Por último Irvine y Moonbay son detenidos por la policía por el robo del motor experimental, al ser traicionados por el Dr. D.

El capitán Herman y el teniente O'Connell recopilaron los datos de la última batalla con Hiltz, además, el Mayor Schwarz envía restos de los insectos de Lise al Dr. D. Más tarde ellos se reúnen junto a Thomas y el Dr. D para analizar los datos obtenidos. En otra parte, Fine, Bang, Moonbay y Irvine analizan estrategias de batalla. En eso son atacados por Hiltz utilizando un Whale King como kamikaze, pero Bang, Irvine y Thomas se lanzan a detenerlo.

Irvine es capturado por un grupo de traficantes de armas, quienes roban su Lightning Saix. Más tarde es encontrado por el servicio secreto republicano, quienes lo inculpan del delito. Mientras es trasladado a en una nave, escapa, pero Carol, la capitán, lo sigue. Aterrizan en una montaña, y ahí hacen las paces. Luego consiguen la información de que quien está detrás de todo es Garth, un general retirado del ejército imperial. Durante la noche se escabullen en su planta de fabricación de armamentos, pero son descubiertos; Carol además revela ser cómplice de Garth. Sin embargo, ella evita la captura de Irvine, y en eso aparecen Bang y Thomas, que lucharán contra los zoids de Garth. Mientras tanto, Irvine lucha contra Carol, quien luego se suicida dejándose estrellar contra el mar.

Un grupo de delincuentes conocidos cono Trinity Ghost envía invitaciones a duelo a diferentes conductores de zoid. Thomas, quien se encuentra investigando sobre ellos, es invitado a luchar, pero luego de atacar a tres Saber Tiger negros, es derrotado por Kerberos, un gigantesco Saber Tiger de tres cabezas. Bang y Fine se dirigen a investigar al lugar del encuentro, y allí encuentran pequeños microchips los que serían los responsables de crear la ilusión del Kerberos. Luego van a la universidad de Thomas, donde conocen, sin saberlo, a los miembros del Trinity Ghost, quienes piensan que un zoid controlado por computadora es mejor que uno pilotado. Más tarde Bang recibe una invitación a luchar, pero como ya conoce la trampa del Kerberos, logra vencer a sus enemigos.

Bang, Irvine y Thomas se preparan para luchar contra Raven. Mientras, Hilzt casi tiene preparado un nuevo zoid. La energía de aquel nuevo zoid, es sentida por Fine, quien luego de investigar descubre el lugar de donde se origina y se dirige a el, seguida por Moonbay y Thomas. Cuando llegan al lugar, aparece Hiltz, quien presenta al Death Stinger. Mientras tanto en la base aparece Raven, y Bang con Irvine lo enfrentan. Cuando pareciera que llevan la ventaja contra Raven, un cañon de partículas electricas del Death Stinger los intersecta desde lo lejos. Hiltz, luego guarda al Death Stinger en su Hammer Kaiser y se retira.

El Hammer Kaiser ha volado hasta una altura tal, que ningún zoids es capaz de alcanzarlo, y desde ahí, el Death Stinger ha comenzado a disparar contra diferentes ciudades. Bang entonces pilotará un Storm Sworder para intentar alcanzarlo, pero una enorme tropa de soldados de Hiltz llegó para detenerlo. Es entonces que decide quedarse a luchar, siendo Irvine y Thomas quienes pilotarán los Storm Sworder. Luego de añadir dispositivos extra para alcanzar la altura requerida, lanzan su ataque contra el Hammer Kaiser y logran derribarlo. Sin embargo, tras la caída, el Death Stinger sale ileso.

Bang debe luchar contra Lise. Entretanto, el cadáver de Shadow se desvanece misteriosamente. Más tarde Hiltz aparece en la capital republicana; Irvine, Thomas, Karl Schwarz y Rob Herman intentan luchar contra él, pero son superados por la inmensa fuerza del Death Stinger. Luego aparece Raven para atacarlo, y es en este momento cuando Rob junto a sus compañeros escapan. Mientras tanto, Lise da por terminada la batalla con Bang y se dirige donde el Death Stinger, que acaba de derrotar a Raven. Es entonces cuando ella confirma que ya no es útil para Hiltz. Ambos son atacados y la cuidad destruida.

Las tropas republicanas y la presidenta se dirigen a la laguna Windeene para refugiarse, y Bang se reúne con sus compañeros. En aquel lugar se encuentra un enorme Ultrasaurus, el cual es la última esperanza para derrotar a Hiltz. Sin embargo, necesita de reparaciones para poder encender. Mientras reparan al Ultrasaurus y Hiltz se acerca, numerosas tropas de Helcat aparecen para atacar al Ultrasaurus, por lo que Bang y Irvine deben luchar contra estas. Durante el ataque, el coronel Krueger resulta herido, es entonces cuando este le sede su rango a Rob Herman. El Ultrasaurus finalmente despierta y escapa hacia el mar.

Bang y Irvine continúan su lucha contra los Helcat, y el Death Stinger casi los alcanza, pero son rescatados por los Barones de Alas, quienes los llevan a bordo del Ultrasaurus. En otro lugar, el Dr. D se encuentra trabajando en un arma secreta para incorporarla al Ultrasaurus. Mientras, en la nave, son atacados por tropas de Sinkers, hasta que finalmente aparece el Death Stinger. Sin embargo, no puede utilizar el cañón de partículas eléctricas bajo el agua, así que utiliza sus garras para atacar, pero el Ultrasaurus usa sus minas para detonar el hidrato de metano del fondo marino y así liberarse del Death Stinger.

El Ultrasaurus llega hasta una base imperial. En aquel lugar, el Dr. D les presenta el Cañón Gravitacional, el arma desarrollada para que el Ultrasaurus enfrente al Death Stinger. A pesar de su inmenso poder, solo cuenta con 3 disparos, y el primero de ellos es utilizado para probar el exitoso funcionamiento del cañón. En otra parte, Raven, quien había escapado del ataque de Hiltz, cuida de Lise.

Bang, Irvine y Thomas practican una nueva formación delta, que crea una barrera que detendrá al Death Stinger. Por otra parte, numerosos poblados están siendo evacuados, debido a que Hiltz ha comenzado a destruirlos. Entre estos se encuentra el poblado de Viola, por lo que ella y Rosso van en el rescate de Rosa. Luego Hiltz se dirige a destruir la prisión, y todos comienzan a escapar. Sin embargo, Stinger y los Hermanos Crossbow se quedan para luchar contra él, y mueren. Más tarde Bang, Irvine y Thomas enfrentan a Hiltz y lo encierran en su barrera, y el Ultrasaurus dispara su cañón, pero Hiltz destruye la barrera y luego se deshace del misil gravitacional. Bang y sus compañeros lo intentan una vez más, utilizando toda su energía para mantener la barrera, y que Hiltz no la destruya. Luego disparan el cañón gravitacional, y el Death Stinger es destruido.

Raven y Lise llegan hasta la guarida de Proitzen (quien ahora se hace llamar Dark Kaiser) para recuperar a Shadow, sin embargo, Shadow ya no reconoce a Raven. En el campo de batalla, Ambient aparece y revive al Death Stinger, aunque ahora su nivel de poder es menor al anterior. Hiltz destruye el suelo que se encuentra bajo los pies del Ultrasaurus, estancándolo, y haciendo que las tropas que se encontraban dentro ya no puedan salir a luchar, por lo que todo queda en manos de Bang y Irvine, además de Fine que transporta al Dibison de Thomas dañado. Al final de la batalla, Hiltz anuncia que pronto todos serán destruidos por el Zoid EVE. Luego Hiltz, el Death Stinger y Fine se desvanecen misteriosamente.

Shadow reconoce a Raven, sin embargo es dañado por Proitzen. En aquel lugar aparece Fine, que fue transportada por Proitzen hasta su base subterránea, para que abriera la puerta a Evepolis, una antigua ciudad oculta en el valle del Rare Hertz, y en donde se encuentra tanto el cuerpo original del Death Saurer, como el Zoid EVE, una antigua fábrica de Zoids Cores que cuenta además con la capacidad de restaurar los zoids dañados. Proitzen busca que Fine libere el poder del Zoid EVE para recuperar el cuerpo del Death Saurer original, pero ella se niega, y amenaza con apagar definitivamente la fábrica. Mientras tanto, Bang se dirige en su ayuda, pero debe enfrentarse a Hiltz y su Death Stinger.

El Ultrasaurus logra levantarse y dirigirse hasta el valle del Rare Hertz. Mientras, Raven y Lise recobran la conciencia, y Raven en su Geno Breaker intenta enfrentar a Proitzen, pero aparecen 3 Geno Saurer para atacarlo. Al ver esto Fine intenta apagar el Zoid EVE, pero una explosión lo activa, y su energía marca el momento esperado para el despertar del Death Saurer. En ese momento el Death Stinger absorve a Hiltz, quien luego revela que Proitzen solo estaba siendo utilizado. Ambos Cores, el de Proitzen y el de Hiltz se fusionan y se unen al verdadero cuerpo del Death Saurer, haciendo que este se despierte. El Ultrasaurus intenta atacarlo, pero es derribado de un solo disparo.

El Death Saurer usa su cañón de partículas eléctricas con lo que causa gran destrucción alrededor del planeta. Ni siquiera las tropas de Helic y Guylos son es capaces de detenerlo. Bang y Raven intentan luchar contra él, pero son derrotados. El plan de Hiltz es acabar con la humanidad, para que solo los zoidianos como él y Fine pueblen el planeta Zi. Frente a esto la única alternativa viable es apagar al Zoid EVE, pero si esto ocurre, se corre el riesgo de que los zoid de todo el mundo se desactiven. Fine intenta apagar al Zoid EVE, pero Bang la detiene, dado que tiene la idea de ser disparado junto al Blade Liger por el cañón gravitacional. Raven entonces se encarga de romper el escudo del Death Saurer, luego Bang es disparado, atravesando su Zoid Core y poniendo fin a la amenaza.