El viaje de MacGyver a una estación de autobuses para recoger a su ahijado, para el Bar Mitzvah de Jeffrey, no acaba como se esperaba. Un helicóptero robado y unos terroristas caribeños tendrán la culpa de un incidente internacional.

Después del incendio de su casa-barco, MacGyver debe mudarse y llega a un nuevo barrio. Allí ayudará a una de sus nuevas vecinas, que está en peligro tras escuchar una conversación entre dos mafiosos.

MacGyver colabora en la protección de un dictador, quien está siendo juzgado en Estados Unidos. Además, está convencido de que Murdoc intentará matar al dictador. La obsesión de MacGyver pondrá en peligro su puesto de trabajo y el de Pete.

Un pirómano psicópata mata a un amigo de MacGyver, quien colaborará con la brigada de incendios. Dicho individuo ya había cometido bastantes incendios con anterioridad y es conocido como Prometeo.

Los hermanos Colton, de profesión cazarrecompensas, y con la ayuda de su madre y de un perro bulldog, buscan a una testigo clave de un asesinato en el barrio chino.

MacGyver se predispone a ayudar a un joven activista estudiantil que ha sido secuestrado por un grupo de haitianos. Ellos trabajan para un sacerdote que hipnotiza al joven utilizando el vudú.

MacGyver sufre una conmoción cerebral que le transporta a la época de la corte del rey Arturo. Allí deberá encontrar a Cecilia y, pese a hacer sombra al mismísimo Merlín con sus habilidades, ayudar al mago que ha sido falsamente acusado.

MacGyver, aún en la corte del rey Arturo, intentará frenar el ascenso al poder del trono por parte de Morgana. Para ello contará con la ayuda de Merlín.

MacGyver ayuda a una antigua estrella cómica del cine mudo, a quien le han robado las únicas copias de algunas de sus películas. Los malechores intentarán atrapar a MacGyver haciendo valer sus habilidades con los efectos especiales.

Earl Dent, un viejo amigo de MacGyver, le pide ayuda ante la situación que se le presenta. Por una parte está luchando por la custodia de su hija, pero también debe preparar su vuelta al cuadrilátero.

MacGyver, junto a una asociación de jóvenes, tratarán de ayudar a un niño acusado de asesinato de otro chico. Detrás de todo hay una banda de traficantes que invaden el barrio de miedo y sospecha.

Un joven artista pide ayuda a MacGyver cuando el propietario de unos terrenos decide expropiar a su abuela de la casa donde ha vivido durante toda su vida.

MacGyver colaborará con un disidente chino en una investigación sobre la importación ilegal de productor elaborados en campos de trabajo. En esta ocasión será ayudado por un joven fotoperiodista que resulta ser el hijo de MacGyver.

MacGyver y Jack Dalton siguen la pista de la fuente de la juventud, por lo que parece ser el mítico territorio de Shangri-La. Pero en su camino también encuentran una base militar donde se fabrica una mortífera bomba.